《神奇寶貝超世代》是系列動畫《神奇寶貝》第二部。其藍本是第四世代游戲（口袋妖怪寶石版）在此系列中，無印篇的女同伴小霞不再跟著小智，而橙華市的新手訓練家小遙加入隊伍。小遙本來只打算旅行，但得知神奇寶貝華麗大賽后，就決定成為協調訓練家。小遙的弟弟，小勝也跟著他們旅行，還帶著神奇寶貝領航員。不過，因為小勝年齡不足，所以沒有神奇寶貝。小智的伙伴，小剛也在此系列的開端回來。